编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入CNVnator安装目录，并做好依赖链接。

   cd /path/to/CNVNATOR
   unzip CNVnator_v0.4.1.zip
   cd CNVnator_v0.4.1/src
   ln -s /path/to/SAMTOOLS/samtools-1.10 samtools
   ln -s /path/to/SOURCE/root_build root_build

3. 执行以下命令修改“Makefile”文件。
   1. 打开“Makefile”文件。

      vi Makefile

   2. 按“i”进入编辑模式，在“Makefile”文件第4行之前加入以下内容。

      ROOTSYS=root_build

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

4. 执行以下命令进行编译。

   make LIBS="-lcrypto"

5. 执行以下命令加载环境变量。

   export PATH=/path/to/CNVNATOR/CNVnator_v0.4.1/src:$PATH