安装R-4.2.0

操作步骤

1. 执行以下命令下载R语言源码包。

   cd /path/to/DECONTAM
   wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.2.0.tar.gz

2. 执行以下命令解压安装

   tar xvf R-4.2.0.tar.gz
   cd R-4.2.0
   yum install libXt-devel libX11-devel readline-devel
   ./configure --prefix=/path/to/DECONTAM/R_install
   make
   make install

3. 执行以下命令加载环境变量

   export PATH=/path/to/DECONTAM/R_install/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/DECONTAM/R_install/lib/R/lib:$LD_LIBRARY_PATH

4. （无R语言镜像源时可选）执行以下命令添加R语言的镜像源

   vim ~/.Rprofile

5. 添加以下内容：

   options("repos"= c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
   options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")