IDBA_UD是用于第二代测序读取的基本迭代de Bruijn图组装器。IDBA_UD是IDBA的扩展,旨在利用双端读取来组装低深度区域,并在contigs上使用渐进深度来减少高深度区域的错误。它是一个通用的汇编器,特别适用于单细胞和宏基因组测序数据。
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语言:C++。
一句话描述:一个第二代测序读取的基本迭代de Bruijn图组装器。
开源协议:自定义开源协议。
使用开源软件时需遵守开源软件的许可协议。
建议使用的版本为"master"。