安装HIO桥接目标库

安装libhdf5.so

1. 下载hdf5源码压缩包hdf5-1.12.3.tar.gz。
2. 使用SFTP工具将hdf5-1.12.3.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。

   tar zxf hdf5-1.12.3.tar.gz

3. 编译安装。
   1. 执行以下命令进入hdf5源码目录并创建build目录。

      cd hdf5-1.12.3

      mkdir build

   2. 执行配置操作。

      cd build

      ../configure --prefix=/path/to/hdf5-install

      

      /path/to/hdf5-install表示libhdf5.so的安装目录，建议与2中的目录区分开。

   3. 执行以下命令编译。

      make -j

   4. 执行以下命令安装。

      make install

4. 执行以下命令检查安装目录确认是否包含hdf5动态库。

   ls /path/to/hdf5-install/lib

   回显如下说明安装目录下已经存在hdf5动态库，表示安装成功。

   libhdf5.a  libhdf5_hl.a  libhdf5_hl.la  libhdf5_hl.so  libhdf5_hl.so.200  libhdf5_hl.so.200.1.1  libhdf5.la  libhdf5.settings  libhdf5.so  libhdf5.so.200  libhdf5.so.200.3.0

安装libnetcdf.so

1. 下载NetCDF源码压缩包netcdf-c-4.9.2.tar.gz。
2. 使用SFTP工具将netcdf-c-4.9.2.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。

   tar zxf netcdf-c-4.9.2.tar.gz

3. 编译安装。
   1. 执行以下命令进入NetCDF源码目录并创建build目录。

      cd netcdf-c-4.9.2

      mkdir build

   2. 执行配置操作。

      cd build

      ../configure --prefix=/path/to/netcdf-install

      

      /path/to/netcdf-install表示libnetcdf.so的安装目录，建议与2中的目录区分开

   3. 执行以下命令编译。

      make -j

   4. 执行以下命令安装。

      make install

4. 执行以下命令检查安装目录确认是否包含NetCDF动态库。

   ls /path/to/netcdf-install/lib

   回显如下说明安装目录下已经存在NetCDF相关动态库，表示安装成功。

   libnetcdf.a  libnetcdf.la  libnetcdf.settings  libnetcdf.so  libnetcdf.so.19  libnetcdf.so.19.2.2  pkgconfig

安装libpnetcdf.so

1. 下载PnetCDF源码压缩包pnetcdf-1.12.1.tar.gz。
2. 使用SFTP工具将pnetcdf-1.12.1.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。

   tar zxf pnetcdf-1.12.1.tar.gz

3. 编译安装。
   1. 进入PnetCDF源码目录并创建build目录。

      cd pnetcdf-1.12.1

      mkdir build

   2. 执行配置操作。

      cd build

      export MPICC=/opt/HPCKit/latest/hmpi/gcc/hmpi/bin/mpicc

      ../configure --prefix=/path/to/pnetcdf-install --enable-shared

      

      • /path/to/pnetcdf-install表示libpnetcdf.so的安装目录，建议与2中的目录区分开。
      • /opt/HPCKit表示HPCKit安装目录。
   3. 执行以下命令编译。

      make -j

   4. 执行以下命令安装。

      make install

4. 执行以下命令检查安装目录确认是否包含PnetCDF动态库。

   ls /path/to/pnetcdf-install/lib

   回显如下说明安装目录下已经存在PnetCDF相关动态库，表示安装成功。

   libpnetcdf.a  libpnetcdf.la  libpnetcdf.so  libpnetcdf.so.4  libpnetcdf.so.4.0.1  pkgconfig

配置HIO桥目标接库的环境变量

• 如果HIO桥接目标库在usr/lib64下已存在，则不用配置环境变量，其他情况都需要配置环境变量。
• 如果多个桥接库不在同一目录下，需要对每个桥接库分别配置环境变量。
• 以下通过为LD_LIBRARY_PATH配置libpnetcdf.so的环境变为例说明。
• 用find命令查找HIO桥接目标库所在目录，将该目录配置到环境变量。

• 仅对当前会话生效：

  export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/pnetcdf-install/lib:$LD_LIBRARY_PATH

• 对当前用户生效：
  1. 执行以下命令，进入~/.bashrc文件。

     vim ~/.bashrc

  2. 按“i”进入编辑模式，在文件~/.bashrc末尾增加如下命令行。

     export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/pnetcdf-install/lib:$LD_LIBRARY_PATH

  3. 按“ESC”退出编辑模式，然后输入":wq!"保存并退出。

  4. 执行以下命令，使配置立即生效。

     source ~/.bashrc