编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压安装包。

   tar -zxvf abyss-2.2.4.tar.gz

3. 执行下列命令解压依赖包。

   cd /path/to/BOOST
   tar jxf boost_1_56_0.tar.bz2

4. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd /path/to/ABYSS/abyss-2.2.4

5. 执行下列命令生成“configure”文件。

   ./autogen.sh

6. 执行以下命令将当前运行的MPI的安装路径添加到临时环境变量当中。

   export CURRENT_MPI_PATH=`which mpirun | sed 's/\/bin\/mpirun//g'`

7. 执行以下命令进行配置。

   ./configure --prefix=/path/to/ABYSS --with-boost=/path/to/BOOST/boost_1_56_0 --without-sparsehash --with-mpi=$CURRENT_MPI_PATH

8. 执行以下命令进行安装编译。

   make -j 32 AM_CXXFLAGS=-Wall
   make install AM_CXXFLAGS=-Wall

9. 执行以下命令添加环境变量。

   export PATH=/path/to/ABYSS/bin:$PATH