运行和验证
操作步骤
- 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
- 执行以下命令创建“hostfile”文件并添加节点信息。
echo -e 'node1\nnode2\n…\nnodex' > /path/to/HOSTFILE
- “node1、node2、…、nodex”分别为各节点的主机名，可通过命令hostname查询各主机名，“\n”为换行符。
- 该步骤在多节点运行时为必须执行，单节点可跳过。
- 执行以下命令进入“test”目录，编译后会生成“amg”二进制文件。
cd /path/to/AMG/AMG-1.2/test
- 执行以下命令进入运行“amg”二进制文件。
mpirun --allow-run-as-root -mca btl ^openib --hostfile /path/to/HOSTFILE -x OMP_NUM_THREADS=1 -x PATH -x LD_LIBRARY_PATH -N 96 amg -P 4 6 4 -n 100 100 100 -printstats
- “-p <Px> <Py> <Pz>”：定义每个零件的处理器拓扑，总计MPI流程为Px * Py * Pz。
- “-n <nx> <ny> <nz>”：为多维数据集上的问题定义每个处理器的大小。“-n”选项允许每个MPI进程指定本地问题的大小， 导致<Px> * <nx>和<Py> * <ny>的<Pz> * <nz>的全局问题大小。
- “-printstats”：打印出有关AMG预处理器的详细信息和迭代次数。
- “-N”：为每个节点的任务数，且Px * Py * Pz的值必须等于-N的值乘以节点数的值。
- 单节点运行时执行以下命令：
mpirun --allow-run-as-root -mca btl ^openib -x OMP_NUM_THREADS=1 -np 96 amg -P 4 6 4 -n 100 100 100 -printstats
打印结果样例如下所示。
BoomerAMG SOLVER PARAMETERS: Maximum number of cycles: 1 Stopping Tolerance: 0.000000e+00 Cycle type (1 = V, 2 = W, etc.): 1 Relaxation Parameters: Visiting Grid: down up coarse Number of sweeps: 2 2 1 Type 0=Jac, 3=hGS, 6=hSGS, 9=GE: 18 18 9 Point types, partial sweeps (1=C, -1=F): Pre-CG relaxation (down): 0 0 Post-CG relaxation (up): 0 0 Coarsest grid: 0 ============================================= Problem 1: AMG Setup Time: ============================================= PCG Setup: wall clock time = 6.333697 seconds wall MFLOPS = 0.000000 cpu clock time = 6.350000 seconds cpu MFLOPS = 0.000000 FOM_Setup: nnz_AP / Setup Phase Time: 4.452531e+08 ============================================= Problem 1: AMG-PCG Solve Time: ============================================= PCG Solve: wall clock time = 34.855871 seconds wall MFLOPS = 0.000000 cpu clock time = 34.860000 seconds cpu MFLOPS = 0.000000 Iterations = 23 Final Relative Residual Norm = 6.624473e-09 FOM_Solve: nnz_AP * Iterations / Solve Phase Time: 1.860870e+09 Figure of Merit (FOM_1): 1.506966e+09