安装Samtools
操作步骤
- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 执行以下命令解压Samtools安装包。
tar -xvf samtools-1.10.tar.bz2
- 执行以下命令进入解压后的目录。
cd samtools-1.10
- 执行以下命令进行安装。
yum install -y bzip2-devel bzip2-libs bzip2
- 执行以下命令进行配置。
./configure --prefix=/path/to/SAMTOOLS
- 执行以下命令进行编译安装。
make all all-htslib make install install-htslib
- 执行以下命令设置Samtools的环境变量。
export PATH=/path/to/SAMTOOLS/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/SAMTOOLS/lib:$LD_LIBRARY_PATH
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