多节点运行和验证
- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 执行以下命令创建并进入算例目录。
cd /path/to/CODE_SATURNE/ mkdir TESTCASE cd TESTCASE
- 执行以下命令创建用例。
code_saturne create -s test -c case1
其中,“test”为自定义的study名称,“case1”为自定义的case名称,可根据实际情况进行修改。此命令会在当前目录下生成“test”目录,并在“test”目录下生成“case1”、“MESH”和“POST”目录。
- 执行以下命令拷贝测试用例文件。
cp /path/to/CODE_SATURNE/code_saturne-6.0.2/examples/1-simple_junction/mesh/* test/MESH -rf cp /path/to/CODE_SATURNE/code_saturne-6.0.2/examples/1-simple_junction/case1/setup.xml test/case1/DATA -rf
- 执行以下命令设置MPI运行参数的环境变量。
export CS_MPIEXEC_OPTIONS="--allow-run-as-root --mca btl ^openib"
- 执行以下命令运行进行算例初始化。
code_saturne run --initialize --param=/path/to/CODE_SATURNE /TESTCASE/test/case1/DATA/setup.xml --case=/path/to/CODE_SATURNE /TESTCASE/test/case1
当运行过程中显示如下信息,则说明初始化成功。
***************************** Preprocessing calculation *****************************
- 执行以下命令创建hostfile文件并添加节点信息。
echo -e 'node1\nnode2\n…\nnodex' > /path/to/HOSTFILE
“node1、node2、…、nodex”分别为各节点的主机名,可通过命令hostname查询各主机名,“\n”为换行符。
- 执行以下命令进入算例执行目录。
cd /path/to/CODE_SATURNE/TESTCASE/test/case1/RESU/year+month+day-hour+minute_round
“RESU”目录下会自动生成每次作业运行的日志,命令规则为“年+月+日-小时+分钟_同一分钟内运行的第x次”,例如“20200330-2104”目录下记录着“2020年03月30日21时04分内第一次运行的作业日志”,“20200330-2104_1”目录下记录着“2020年03月30日21时04分内第二次运行的作业日志”。
- 执行以下命令进行算例的多节点运行。
time mpirun --allow-run-as-root --mca btl ^openib -N 96 -x OMP_NUM_THREADS=1 --hostfile /path/to/HOSTFILE ./cs_solver --mpi
查看“performance.log”日志的指标“Elapsed time: XX s”,时间单位是“s”,数值越少性能越优。
输出的结果样例如图1所示。
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