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介绍

CPAT是一种基于RNA序列特征预测RNA编码概率的生物信息学工具。为了实现这一目标,CPAT从一组已知的蛋白质编码基因和另一组非编码基因中计算以下4种语言特征的分数。

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  • 六聚体使用偏差

然后,CPAT将使用这4个特征作为预测变量,将“蛋白质编码状态”作为响应变量,构建一个逻辑回归模型。在评估性能并确定概率截止后,该模型可用于预测新的RNA序列。

关于CPAT的更多信息请访问CPAT官网

语言:Python。

一句话描述:一种基于RNA序列特征预测RNA编码概率的生物信息学工具。

协议:GNU General Public License。

建议的版本

建议使用的版本为“CPAT 3.0.4”。