运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令，进入算例文件夹并且解压算例。

   cd /path/to/TESTCASE

   gzip -d human_g1k_v37.fasta.gz

   gzip -d swissprot.gz

3. 执行以下命令，运行算例。

   diamond blastp -p 128 -q human_g1k_v37.fasta -d swissprot -o out.tsv --very-sensitive

   运行完成后命令行将回显以下类似信息。

   .......
   Loading reference sequences...  [0s]
   Deallocating buffers...  [0s]
   Deallocating queries...  [0.002s]
   Loading query sequences...  [0s]
   Closing the input file...  [0s]
   Closing the output file...  [0s]
   Closing the database file...  [0.003s]
   Deallocating taxonomy...  [0s]
   Total time = 538.485s
   Reported 0 pairwise alignments, 0 HSPs.
   0 queries aligned.