安装Samtools
操作步骤
- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 执行以下命令解压Samtools安装包。
tar -xvf samtools-0.1.9.tar.bz2
- 执行以下命令进入解压后的目录。
cd samtools-0.1.9
- 执行以下命令安装依赖包。
yum install xz-devel-5.2.2-1.el7.aarch64 bzip2-devel-1.0.6-13.el7.aarch64 ncurses-devel.aarch64 -y
- 执行以下命令进行配置。
./configure --prefix=/path/to/SAMTOOLS
- 执行以下命令进行编译。
make make install
- 执行以下命令设置Samtools的环境变量。
export PATH=/path/to/SAMTOOLS/bin:$PATH
- 执行以下命令验证Samtools安装是否成功。
samtools
显示类似如下Samtools使用信息,说明安装成功。
Program: samtools (Tools for alignments in the SAM format) Version: 0.1.9 (r183) Usage: samtools <command> [options]
父主题: 配置编译环境