运行和验证

操作步骤

1. 执行以下命令，进入算例目录。

   cd /path/to/TESTCASE

2. 执行以下命令，解压算例文件包。

   gzip -d Drosophila_melanogaster.BDGP6.dna.toplevel.fa.gz

   gzip -d R1.fq.gz

   gzip -d R2.fq.gz

3. 执行以下命令，重命名“fa”文件。

   mv Drosophila_melanogaster.BDGP6.dna.toplevel.fa genome.fa

4. 执行以下命令，建立基因组索引。

   hisat-build genome.fa genome

5. 执行以下命令，进行基因序列比对。

   hisat -t -x genome -p 96 -1 R1.fq -2 R2.fq -S result.sam

   显示下列信息，则运行验证成功。