运行和验证
操作步骤
- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 执行以下命令进入主程序安装目录。
cd /path/to/homer
- 执行以下命令下载测试文件。
wget https://phoenixnap.dl.sourceforge.net/project/rseqc/BED/Human_Homo_sapiens/hg19_RefSeq.bed.gz
- 执行以下命令解压测试文件。
gzip -d hg19_RefSeq.bed.gz
- 执行以下命令进行测试。
findMotifsGenome.pl hg19_RefSeq.bed hg19 H3K4Me3_motif -len 8,10,12
测试执行时间需要约100分钟。
测试结果在此目录下。