编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入主程序安装目录。

   cd /path/to/LAMMPS

3. 执行以下命令解压安装包。

   tar -xvf lammps-10Feb2021.tar.gz

4. 执行以下命令进入解压后路径。

   cd lammps-10Feb21

5. 编辑GPU模块，执行以下命令修改配置文件“Makefile.linux”。
   1. 打开配置文件“Makefile.linux”。

      cd lib/gpu
      vi Makefile.linux

   2. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

      CUDA_HOME = /usr/local/cuda-11.4
      NVCC=nvcc
      CUDA_ARCH=-arch=sm_80  #显卡对应的型号，当前环境使用A100（Ampere架构）
      CUDA_PRECISION=-D_DOUBLE_DOUBLE  #计算精度

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令编译Lammps GPU模块。

   make -f Makefile.linux -j 16

7. 执行以下命令查看GPU信息。

   ./nvc_get_devices

   回显显示如下内容，表示编译成功。

   Found 1 platform(s).
   Using platform: NVIDIA Corporation NVIDIA CUDA Driver
   CUDA Driver Version:                           11.40
   Device 0: "NVIDIA A100-PCIE-40GB"
   Type of device:                                GPU
   Compute capability:                             8
   Double precision support:                        Yes
   Total amount of global memory:                   39.5861 GB
   Number of compute units/multiprocessors:           108
   Number of cores:                               20736
   Total amount of constant memory:                 65536 bytes
   Total amount of local/shared memory per block:      49152 bytes
   Total number of registers available per block: 65536
   Warp size:                                     32
   Maximum number of threads per block:             1024
   Maximum group size (# of threads per block)         1024 x 1024 x 64
   Maximum item sizes (# threads for each dim)         2147483647 x 65535 x 65535
   Maximum memory pitch:                         2147483647 bytes
   Texture alignment:                              512 bytes
   Clock rate:                                    1.41 GHz
   Run time limit on kernels:                        No
   Integrated:                                    No
   Support host page-locked memory mapping:         Yes
   Compute mode:                                Default
   Concurrent kernel execution:                     Yes
   Device has ECC support enabled:                 Yes

8. 执行以下命令进入“src”目录。

   cd ../../src

9. 执行以下命令修改“MAKE/OPTIONS/Makefile.g++_openmpi”文件。
   1. 打开“MAKE/OPTIONS/Makefile.g++_openmpi”文件。

      vi MAKE/OPTIONS/Makefile.g++_openmpi

   2. 按“i”进入编辑模式，修改第54、55和56行的内容。

      FFT_INC =    -DFFT_FFTW -I/path/to/FFTW/include
      FFT_PATH =  -L/path/to/FFTW/lib
      FFT_LIB =    -lfftw3

      

      执行9.a之后，按“Esc”键，输入“:set nu”，按“Enter”即可显示出行号。

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
10. 执行以下命令开始编译。

    make yes-std
    make no-lib
    make yes-gpu
    make -j 96 g++_openmpi