安装RMBlast
操作步骤
- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 执行以下命令解压源码包。
tar zxvf ncbi-rmblastn-2.2.28-src.tar.gz
- 执行以下命令进入解压后目录。
cd ncbi-rmblastn-2.2.28-src
- 执行以下命令修改“configure”文件。
- 打开“configure”文件。
vi src/build-system/configure
- 按“i”进入编辑模式,修改为第4749行的内容。
4746 if test "$GCC" = "yes" ; then 4747 compiler_ver="`$real_CXX -dumpversion 2>&1`" 4748 case "$compiler_ver" in 4749 2.95* | 2.96* | 3.* | 4.* | 7.*) 4750 compiler="GCC" 4751 ncbi_compiler="GCC" 4752 ncbi_compiler_ver="$compiler_ver"
- 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。
- 打开“configure”文件。
- 执行以下命令编译安装。
./configure --prefix=/path/to/rmblas --build=aarch64-unknown-linux-gnu --without-debug --with-mt CFLAGS=-Wno-narrowing CXXFLAGS=-Wno-narrowing make -j make -j install
- 执行以下命令加载环境变量。
export PATH=/path/to/rmblast/bin:$PATH
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