运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进行导入。

   python3
   import mCaller

   若回显信息中未报错，则表示导入成功。

   

3. 执行以下命令运行mCaller。（以下为示例）

   cd /path/to/mCaller
   python3 mCaller.py -p testdata/test_positions.txt -r testdata/pb_ecoli_polished_assembly.fasta -e testdata/masonread1.eventalign.tsv -t 4 --train -f testdata/masonread1.fastq

   

   python3 make_bed.py -f testdata/masonread1.eventalign.diffs.6 -d 1 -t 0.5