编译和安装

操作步骤

使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
执行以下命令进入源码安装目录。
```
cd /path/to/MEGAHIT
```
执行以下命令解压源码包。
```
tar -xvf v1.2.9.tar.gz
```
执行以下命令进入解压后的文件夹。
```
cd megahit-1.2.9
```

执行以下命令修改“CMakeLists.txt”文件。

打开“CMakeLists.txt”文件。
```
vi CMakeLists.txt
```

按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

修改前：

6     set(CMAKE_CXX_FLAGS "${CMAKE_CXX_FLAGS} -std=c++11")
…
76 set_target_properties(megahit_core PROPERTIES COMPILE_FLAGS "-mbmi2 -DUSE_BMI2 -mpopcnt")
77 set_target_properties(megahit_core_popcnt PROPERTIES COMPILE_FLAGS "-mpopcnt")

修改后：

6     set(CMAKE_CXX_FLAGS "${CMAKE_CXX_FLAGS} -std=c++11 -march=armv8.2-a")
…
76 set_target_properties(megahit_core PROPERTIES COMPILE_FLAGS "")
77 set_target_properties(megahit_core_popcnt PROPERTIES COMPILE_FLAGS "")

按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

执行以下命令切换目录。
```
cd ./src/utils/
```
执行以下命令拷贝鲲鹏代码迁移工具中的头文件到当前目录。
```
cp /path/to/PORT_ADVISOR/portadv/tools/inline_asm/config/KunpengTrans.h ./
```

执行以下命令修改代码“cpu_dispatch.h”。

vi cpu_dispatch.h

新增代码已标记：

#if defined(__aarch64__)       //新增代码
  #include "KunpengTrans.h"     //新增代码
#endif      //新增代码
 
#ifndef MEGAHIT_CPU_DISPATCH_H
#define MEGAHIT_CPU_DISPATCH_H
 
inline bool HasPopcnt() {
  unsigned eax, ebx, ecx, edx;
#ifdef _MSC_VER
  int cpuid[4];
  __cpuid(cpuid, 1);
  eax = cpuid[0], ebx = cpuid[1], ecx = cpuid[2], edx = cpuid[3];
#else
#if defined(__x86_64__)    //新增代码
  asm volatile("cpuid\n\t"
               : "=a"(eax), "=b"(ebx), "=c"(ecx), "=d"(edx)
               : "0"(1));
#elif defined(__aarch64__)    //新增代码
  {
    eax = 1;      //新增代码
    GetSupportedCPUID(&eax,&ebx,&ecx,&edx);     //新增代码
  }
#endif  //新增代码
#endif
  return ecx >> 23U & 1U;
}
 
inline bool HasBmi2() {
  unsigned eax, ebx, ecx, edx;
#ifdef _MSC_VER
  int cpuid[4];
  __cpuidex(cpuid, 7, 0);
  eax = cpuid[0], ebx = cpuid[1], ecx = cpuid[2], edx = cpuid[3];
#else
#if defined(__x86_64__)    //新增代码
  asm volatile("cpuid\n\t"
               : "=a"(eax), "=b"(ebx), "=c"(ecx), "=d"(edx)
               : "0"(7), "2"(0));
#elif defined(__aarch64__)        //新增代码
  {
    eax = 7;    //新增代码
    ecx = 0;    //新增代码
    GetSupportedCPUID(&eax,&ebx,&ecx,&edx);    //新增代码
  }
#endif    //新增代码
#endif
  return ebx >> 8U & 1U;
}
 
#endif  // MEGAHIT_CPU_DISPATCH_H

执行以下命令切换目录。
```
cd ../kmlib/
```
执行以下命令修改代码kmrns.h，替换头文件。
```
vi kmrns.h
```
修改前：
```
#include <x86intrin.h>
```
修改后：
```
#include <sse2neon.h>
```

执行以下命令拷贝sse2neon.h头文件到src目录。

cp /path/to/SSE2NEON/sse2neon-1.5.0/sse2neon.h /path/to/MEGAHIT/megahit-1.2.9/src

执行以下命令创建并进入构建文件夹。

mkdir /path/to/MEGAHIT/build && cd /path/to/MEGAHIT/build

执行以下命令进行编译安装。

CC=`which gcc` CXX=`which g++` cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/MEGAHIT -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release ../
make -j 16
make install

执行以下命令加载环境变量。
```
export PATH=/path/to/MEGAHIT/bin:$PATH
```

父主题： megahit 1.2.9 移植指南（CentOS 7.6）