运行和验证
操作步骤
- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 执行以下命令进入工作路径。
cd /path/to/NEMO/NEMO/releases/release-3.6/NEMOGCM/CONFIG/MY_AMM12/EXP00
- 上传“AMM12_v3.6.tar”到“/path/to/NEMO/NEMO/releases/release-3.6/NEMOGCM/CONFIG/MY_AMM12/EXP00”。
- 执行以下命令进行解压。
tar xf AMM12_v3.6.tar gunzip *.gz */*.gz rm domain_def.xml field_def.xml namelist_ref -f ln -s ../../SHARED/domain_def.xml ./domain_def.xml ln -s ../../SHARED/field_def.xml ./field_def.xml ln -s ../../SHARED/namelist_ref ./namelist_ref
- 执行以下命令创建“host”文件。
- 创建“host”文件。
vi hostfile
- 按“i”进入编辑模式,新增如下内容。
node1 node2
- 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。
- 创建“host”文件。
- 执行以下命令运行NEMO程序。
{ time mpirun --allow-run-as-root -np 192 -N 96 -hostfile hostfile --mca btl ^openib ./opa ; } 2>&1 | tee -a NEMO.log
表1 参数说明 参数
说明
-np
测试使用的总进程数。
-N
每个服务器上运行的进程数。
--hostfile
使用的节点名字。
当NEMO生成的日志“ocean.output”的结尾处出现如图1所示内容时,表示NEMO程序运行正常结束。
需要查看“NEMO.log”日志中的“real”数值,单位是s,数值越高性能越低,输出的结果如图2所示。