编译和安装
- 使用Putty工具，以root用户登录服务器。
- 执行以下命令安装Numpy。
pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple numpy
- 执行以下命令安装scipy。
LAPACK=/path/to/OPENBLAS/lib/libopenblas.so BLAS=/path/to/OPENBLAS/lib/libopenblas.so pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple scipy
- 执行以下命令安装Ont-tombo。
CFLAGS="-I/path/to/HDF5/include -L/path/to/HDF5/lib" pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple ont-tombo
安装完成显示如下实例信息，则表示安装成功。Successfully installed cython-0.29.15 future-0.18.2 h5py-2.10.0 mappy-2.17 ont-tombo-1.5.1 tqdm-4.43.0