编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入主程序安装目录。

   cd /path/to/RELION

3. 执行以下命令解压安装包。

   tar -xvf 3.1.2.tar.gz

4. 执行以下命令进入解压后路径并创建“build”目录。

   cd relion-3.1.2
   mkdir build

5. 执行以下命令进行配置。

   yum install -y libtiff-* fltk* fltk-devel*
   yum -y install xorg-x11-xauth
   cd build
   export FFTW_HOME=/path/to/FFTW
   export FFTW_LIB=$FFTW_HOME/lib
   export FFTW_INCLUDE=$FFTW_HOME/include
   cmake  -DBUILD_SHARED_LIBS=OFF -DCUDA=ON  -DCudaTexture=ON -DCUDA_ARCH=80 -DCMAKE_BUILD_TYPE=release  -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/install/RELION  ..

   

   -DCUDA_ARCH的值需对应显卡的计算能力，最低35，如A100为80、V100为70，具体可通过NVIDIA网页进行查看。

6. 执行以下命令开始编译。

   make -j40
   make -j40 install

7. 执行以下命令查看RELION版本。

   /path/to/install/RELION/bin/relion_refine_mpi --help

   

8. 执行以下命令设置环境变量。

   export PATH=/path/to/install/RELION/bin:$PATH