编译和安装
操作步骤
- 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
- 执行以下命令进入SPIDER安装目录。
cd /path/to/SPIDER
- 执行以下命令解压安装包。
tar -xvf spiderweb.24.08.tar.gz
- 执行以下命令进入解压后Web模块编译目录。
cd web/src
- 执行以下命令安装依赖包。
yum install motif libXp libXt libX11 libSM libxcb libXau libXp-devel motif-devel
执行echo $DISPLAY命令后，若无输出请重新打开shell窗口查看。
- 执行以下命令开始编译Web模块。
make -f Makefile_linux_dir64
- 执行以下命令进入解压后SPIDER模块编译目录。
cd ../../spider/src
- 修改配置文件，详见表1。
表1 修改配置文件 文件名称
操作步骤
star2doc.f
- 执行以下命令打开“star2doc.f”文件。
vi star2doc.f
- 执行以下命令设置行号。
:set nu
- 按“i”进入编辑模式。修改第358行内容如下：
358 READ(CTOKEN(1:NCHAR),*) IDLIST
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
pw3sr.f
- 执行以下命令打开“pw3sr.f”文件。
vi pw3sr.f
- 执行以下命令设置行号。
:set nu
- 按“i”进入编辑模式。修改第37行、第38行内容如下：
37 INTEGER :: NX,NY,NZ 38 REAL :: Q(NX+2-MOD(NX,2),NY,NZ)
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
pw2sr.f
- 执行以下命令打开“pw2sr.f”文件。
vi pw2sr.f
- 执行以下命令设置行号。
:set nu
- 按“i”进入编辑模式。修改第241行、第242行内容如下：
241 INTEGER :: NX,NY 242 REAL :: Q(NX+2-MOD(NX,2), NY)
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
pr3d.f
- 执行以下命令打开“pr3d.f”文件。
vi pr3d.f
- 执行以下命令设置行号。
:set nu
- 按“i”进入编辑模式。修改第88行内容如下：
88 WANTSQRTS = (FSCOP .eqv. .TRUE.)
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
Makefile_linux.gfort
- 执行以下命令打开“Makefile_linux.gfort”文件。
vi Makefile_linux.gfort
- 执行以下命令设置行号。
:set nu
- 按“i”进入编辑模式。修改第39行内容如下：
39 FFTWLIBDIR = path/to/fftw/lib
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
- 执行以下命令打开“star2doc.f”文件。
- 执行以下命令编译SPIDER模块。
yum install gcc-gfortran.aarch64 make -f Makefile_linux.gfort