编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令安装系统的依赖包“zlib-devel”。

   yum install zlib-devel -y

   

   Yum源为CentOS7.6镜像本地源，可自行根据需要在“/etc/yum.repos.d”路径下修改文件配置。

3. 执行以下命令解压STAR安装包。

   tar -xvf STAR-2.7.1a.tar.gz

4. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd STAR-2.7.1a
   export BLAST_TOP=`pwd`

5. 执行以下命令修改“Makefile”文件。
   1. 打开“Makefile”文件。

      vi source/Makefile

   2. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

      LDFLAGSextra ?= -flto -march=native -mcpu=tsv110
      CXXFLAGSextra ?= -flto -march=native -mcpu=tsv110

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令编译安装STAR。

   cd source
   make STAR

7. 执行以下命令查看是否生成可执行文件。

   ll

   -rwxr-xr-x 1 root root 2018464 Aug  9 13:29 STAR

8. 执行以下命令设置STAR环境变量。

   export PATH=/path/to/STAR/STAR-2.7.1a/source/:$PATH