编译和安装

操作步骤

1. 执行以下命令解压安装包。

   unzip hmmer-h3-arm.zip -d /path/to/hmmer
   unzip easel-master.zip -d /path/to/hmmer/hmmer-h3-arm

2. 执行以下命令进入源码目录修改相关目录名称。

   cd /path/to/hmmer
   mv hmmer-h3-arm/ hmmer-3.3.2/
   cd hmmer-3.3.2/
   mv easel-master/ easel/

3. 执行以下命令设置环境变量。

   export MPICC=mpicc
   export MPICXX=mpicxx
   export MPIFC=mpifort
   export CC=$MPICC
   export CXX=$MPICXX
   export FC=$MPIFC

4. 执行以下命令生成makefile。

   autoconf
   ./configure --prefix=/path/to/hmmer/hmmer --enable-mpi --enable-neon CC=$MPICC CXX=$MPICXX FC=$MPIFC F77=$MPIFC

5. 执行以下命令进行安装编译。

   make -j$(nproc)
   make check
   make -j$(nproc) install

6. 执行以下命令加载hmmer环境变量。

   export PATH=/path/to/hmmer/hmmer/bin:$PATH

7. （可选）执行以下命令安装easel库。

   cd easel/
   make install