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运行和验证

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令创建算例文件夹。
    cd /path/to/ABINIT/abinit-8.10.3/tests/tutorial/Input
    mkdir Work_paral
  3. 执行以下命令进入算例文件夹。
    cd Work_paral
  4. 执行以下命令复制算例文件。
    cp ../tbasepar_1.files .
    cp ../tbasepar_1.in .
  5. 执行以下命令串行执行。
    abinit < tbasepar_1.files > log 2> err
  6. 执行以下命令创建文件夹。
    mkdir tmp
  7. 执行以下命令创建算例文件。
    1. 创建算例文件。
      vi tbase1_x.files
    2. 按“i”进入编辑模式,写入如下内容。
      tbasepar_1.in
      tbasepar_1.out
      tbasepar_1i
      tbasepar_1o
      ./tmp/tbasepar_1
      ../../../Psps_for_tests/HGH/82pb.4.hgh
    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。
  8. 执行以下命令进行计算。
    mpirun --allow-run-as-root -np 32 ../../../../build/src/98_main/abinit < tbasepar_1.files >&tbasepar_1.log &
  9. 若需要多节点测试,则执行以下命令编辑“hostfile”文件。
    1. 打开“hostfile”文件。
      vi hostfile
    2. 按“i”进入编辑模式,编辑如下内容。
      Node1
      Node2

      Node1和Node2为主机名,请依照实际情况修改,并保证节点相互可以Ping通。

    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。
  10. 若是多节点测试,则执行以下命令进行多节点计算。
    mpirun --allow-run-as-root -x PATH=$PATH -x LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH --hostfile hostfile -np 32  -N 16../../../../build/src/98 main/abinit < tbasepar_1.files >&tbasepar_1.log &

    参数

    说明

    -np

    测试使用的总进程数。

    -N

    每个服务器上运行的进程数。

    --hostfile

    使用的节点名字。

  11. 执行以下命令查看“tbasepar_1.log”日志,查看获得时间。
    vi tbasepar_1.log

    输出结果如下图所示。