运行和验证
多节点运行时需进行网络环境配置：
- 在“ /etc/hosts”中添加多台机器的IP与hostname。
- 配置多台机器间的SSH免密登录。
- 关闭防火墙，并使客户端与服务器之前保持不断开状态。
操作步骤
- 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
- 执行以下命加载环境变量。
export PATH=/path/to/CP2K/cp2k-7.1.0/exe/Linux-x86-64-gfortran:$PATH
- 执行以下命令创建“hostfile”文件。
- 创建“hostfile”文件。
vi hostfile
- 按“i”进入编辑模式，新增如下内容。
Node1 Node2
Node1和Node2为主机名，请依照实际情况修改，并保证节点相互可以Ping通。
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
- 创建“hostfile”文件。
- 在root用户下，执行以下命令。
- 单节点
mpirun --allow-run-as-root -np 96 -x OMP_NUM_THREADS=1 cp2k.psmp /path/to/CP2K/cp2k-7.1.0/benchmarks/QS/H2O-256.inp > cp2k.H2O-256.inp.log
- 双节点
mpirun --allow-run-as-root -np 192 -N 96 -x PATH=$PATH -x LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH -hostfile hostfile -x OMP_NUM_THREADS=1 cp2k.psmp /path/to/CP2K/cp2k-7.1.0/benchmarks/QS/H2O-256.inp > cp2k.H2O-256.inp.log
表1 参数说明 参数
说明
-np
MPI运行的总进程数。
-N
每个节点上运行的进程数。
-hostfile
使用的节点名字。
- 单节点
