安装HDF5

操作步骤

请注意：NCL-6.6.2版本使用的HDF5版本应为1.10.x。

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建安装目录。

   mkdir -p /path/to/hdf5

3. 执行以下命令进入安装目录。

   cd /path/to/hdf5

4. 执行以下命令获取源码。

   wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.1/src/hdf5-1.10.1.tar.gz

5. 执行以下命令解压HDF5安装包。

   tar -zxvf hdf5-1.10.1.tar.gz

6. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd hdf5-1.10.1

7. 执行以下命令进行配置。

   export CC=mpicc CXX=mpicxx FC=mpif90 F77=mpif90 
   ./configure --prefix=/path/to/hdf5 --enable-fortran --enable-static=yes --enable-parallel --enable-shared CFLAGS="-O3 -fPIC -Wno-incompatible-pointer-types-discards-qualifiers -Wno-non-literal-null-conversion" FCFLAGS="-O3 -fPIC" LDFLAGS="-Wl,--build-id" --build=aarch64-unknown-linux-gnu

8. 执行以下命令修改libtool。

   sed -i '11835c wl="-Wl,"' libtool

9. 执行以下命令编译并安装。

   make -j 8

   make install

10. 执行以下命令设置环境变量。

    export PATH=/path/to/hdf5/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/hdf5/lib:$LD_LIBRARY_PATH
    export INCLUDE=/path/to/hdf5/include:$INCLUDE