运行和验证
- 运行时指定的进程数需要根据服务器配置而改变。
- 多节点运行时需要进行网络环境配置：
- 在“/etc/hosts”中添加多台服务器的IP与hostname。
- 配置多台服务器间的SSH免密登录。
- 关闭防火墙，并使客户端与服务器之前保持不断开状态。
操作步骤
- 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
- 执行下列命令，将源码包中Tests目录复制到算例目录。
cd /path/to/SIESTA cp -r ./siesta-4.0.2/Tests /path/to/TESTCASE
- 执行下列命令，进入算例目录。
cd /path/to/TESTCASE/Tests/h2o
- 执行以下命令配置运行文件。
- 打开运行文件。
vi ../test.mk
- 按“i”进入编辑模式，修改第10行的内容。
- 单节点运行时
SIESTA= time -p mpirun --allow-run-as-root -np 8 /path/to/SIESTA/siesta-4.0.2/kpgcc_hmpi_compiler/siesta
- 多节点运行时
SIESTA= time -p mpirun --allow-run-as-root -x PATH=$（PATH） -x LD_LIBRARY_PATH=$（LD_LIBRARY_PATH） --hostfile /home/hostfile -np 16 -N 8 /path/to/SIESTA/siesta-4.0.2/kpgcc_hmpi_compiler/siesta
表1 参数说明 参数
说明
-np
测试使用过的总进程数。
-N
每个服务器上运行的进程数。
--hostfile
使用的节点名称。
- 单节点运行时
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
- 打开运行文件。
- 执行以下命令创建“host”文件。
- 创建“host”文件。
cd /home vi hostfile
- 按“i”进入编辑模式，新增如下内容。
node1 node2
node1 node2为服务器的主机名。
- 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
- 创建“host”文件。
- 执行以下命令运行SIESTA算例。
cd /path/to/TESTCASE/Tests/h2o make
