使用HPCRunner一键构建镜像

前置条件

• 待构建镜像的节点已挂载配置YUM源。
  

  YUM源挂载配置建议使用全量的ISO Everything包。

• 待构建镜像的节点需要服务器有外网权限。如无外网权限请先配置外网权限或外网代理。

安装步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录节点。
2. 安装基础依赖包。执行如下命令：

   yum -y install git time zlib zlib-devel gcc gcc-c++ environment-modules python python3 python3-devel python3-libs python3-pip cmake make numactl numactl-devel numactl-libs rpmdevtools wget libtirpc libtirpc-devel unzip flex tar patch glibc-devel rpcbind csh perl-XML-LibXML xorg-x11-xauth curl curl-devel libcurl-devel libxml2-devel

3. 克隆仓库。如已通过手动下载了贾维斯智能助手（HPCRunner），则忽略该步骤，否则执行如下命令：

   git clone https://gitee.com/openeuler/hpcrunner.git

   回显结果包含如下示例内容，表示HPCRunner克隆成功：

   ...
   Cloning into 'hpcrunner'...
   remote: Enumerating objects: 13018, done.
   remote: Counting objects: 100% (171/171), done.
   remote: Compressing objects: 100% (142/142), done.
   remote: Total 13018 (delta 89), reused 57 (delta 23), pack-reused 12847 (from 1)
   Receiving objects: 100% (13018/13018), 72.71 MiB | 2.57 MiB/s, done.
   Resolving deltas: 100% (6150/6150), done.

4. 初始化HPCRunner。执行如下命令：

   cd /home/hpcrunner

   source init.sh

   

   /home/hpcrunner: 表示HPCRunner所在目录，请根据实际目录名称情况调整。

5. 安装go。执行如下命令：

   ./jarvis -install go/1.18 com

   回显结果包含如下示例内容，表示go安装成功：

   ...
   SUCCESSFULLY EXECUTED AT 2025-10-13 09:51:31, CONGRATULATIONS!!!

   

   • 若网络条件不佳或在线下载较慢，可提前将go软件的安装包提前下载至HPCRunner的downloads目录,以避免解压或编译安装失败。

     go软件的下载地址为：https://go.dev/dl/go1.18.linux-arm64

6. 配置加载go环境变量。执行如下命令：

   module load ${JARVIS_ROOT}/software/modulefiles/go/1.18

   无回显结果表示正常。

7. 安装singularity。执行如下命令：

   ./jarvis -install singularity/3.9.6 any

   回显结果包含如下示例内容，表示singularity安装成功：

   ...
   SUCCESSFULLY EXECUTED AT 2025-10-13 09:55:31, CONGRATULATIONS!!!

   

   若网络条件不佳或在线下载较慢，可提前将singularity软件的安装包提前下载至HPCRunner的downloads目录,以避免解压或编译安装失败。

   singularity软件的下载地址为：https://github.com/sylabs/singularity/releases/download/v3.9.6/singularity-ce-3.9.6.tar.gz

8. 配置加载singularity环境变量。执行如下命令：

   module load ${JARVIS_ROOT}/software/modulefiles/singularity/3.9.6

   无回显结果表示正常。

9. 使用singularity拉取rocker/rstudio镜像。执行如下命令：

   singularity pull ${HOME}/rstudio.sif docker://docker.1ms.run/rocker/rstudio:4.4.3

   

   • 运行“singularity pull”命令需要服务器有外网权限。如无外网权限请先配置外网权限或外网代理。
   • ${HOME}/rstudio.sif表示生成的.sif文件保存到当前用户家目录。
10. 启动实例。执行如下命令：

    singularity instance start --writable-tmpfs --bind /etc/passwd:/etc/passwd:ro --bind /etc/group:/etc/group:ro --bind /etc/shadow:/etc/shadow:ro --bind /home:/home:rw ${HOME}/rstudio.sif myrstudio

    回显结果包含如下示例内容，表示运行测试成功：

    INFO:instancestartedsuccessfully

11. 检查实例运行状态，执行如下命令：

    singularity instance list

    回显结果包含如下示例内容，表示实例已启动：

    INSTANCE NAME    PID       IP    IMAGE
    myrstudio        913669          /root/rstudio.sif

12. 进入实例。

    singularity shell instance://myrstudio

    回显如下，表示已进入实例环境

    Singularity> 

    在实例环境中，执行如下命令，启动rsutdio server。

    /usr/local/bin/rstudio-server start

    回显如下，表示表示启动成功。

    Singularity> /usr/local/bin/rstudio-server start
    TTY detected. Printing informational message about logging configuration. Logging configuration loaded from '/etc/rstudio/logging.conf'. Logging to 'syslog'.
    TTY detected. Printing informational message about logging configuration. Logging configuration loaded from '/etc/rstudio/logging.conf'. Logging to 'syslog'.

    然后输入exit命令，退出实例即可。

    使用浏览器，访问http://10.0.0.1:8787,并使用OS用户登录，观察界面如下，表示登录成功：

    

    

    10.0.0.1：表示服务启动节点的ip地址，请根据实际情况修改。

13. （可选）如果需要停止实例，执行以下命令。

    singularity instance stop myrstudio

    回显如下，表示停止成功。

    INFO:    Stopping myrstudio instance of /root/rstudio.sif (PID=913669)