编译Cufflinks时报could not detect bam错误

问题现象描述

编译Cufflinks时报错，报错信息为：“error:we could not detect bam”。

关键过程、根本原因分析

• configure文件中判断设置错误；
• configure文件中指定通过<bam/version.hpp>来判断bam版本。

结论、解决方案及效果

• configure文件中判断设置错误。
  执行以下命令修改“configure”文件。

  1. 打开“configure”文件。

     vi configure

  2. 按“i”进入编辑模式，修改“configure”文件的第5380行，将“no”改为“yes”。

     succeeded=yes

  3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
• configure文件中指定通过<bam/version.hpp>来判断bam版本，事实上bam的version文件为version.h。
  执行以下命令修改“configure”文件。

  1. 打开“configure”文件。

     vi configure

  2. 按“i”进入编辑模式，将“bam/version.hpp”改为“bam/version.h”。

     bam/version.h

  3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。