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title: 介绍
description: "分子动力学模拟（molecular dynamics simulation，MD）是时下最广泛为人采用的计算庞大复杂系统的方法，自1970年起，由于分子模拟的发展迅速，人们系统地建立了许多适用于生化分子体系、聚合物、金属与非金属材料的力场，使得计算复杂体系的结构与一些热力学与光谱性质的能力及精准性大为提升。分子动力学模拟是应用这些力场及根据牛顿运动力学原理所发展的计算方法。"
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# 介绍

分子动力学模拟（molecular dynamics simulation，MD）是时下最广泛为人采用的计算庞大复杂系统的方法，自1970年起，由于分子模拟的发展迅速，人们系统地建立了许多适用于生化分子体系、聚合物、金属与非金属材料的力场，使得计算复杂体系的结构与一些热力学与光谱性质的能力及精准性大为提升。分子动力学模拟是应用这些力场及根据牛顿运动力学原理所发展的计算方法。

Amber是目前应用较为广泛的分子动力学模拟软件之一，软件经过十几年的发展，已经非常成熟，支持GPU加速、增强采样算法、自由能预测、QM/MM等方法。在蛋白质、多肽、多糖、核酸、磷脂等生物分子的模拟中有广泛应用。

关于Amber的更多信息请访问Amber官网(http://Ambermd.org/index.php)。

开发语言：C。

一句话描述：Amber是目前应用较为广泛的分子动力学模拟软件之一。

开源协议：自定义开源协议。

#### 建议的版本

建议使用版本为“Amber20”。