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title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/centos_kunpeng_amber_20_02_0014.html
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# 运行和验证

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入测试目录。

```
cd
/path/to/CASE
```


3. 执行以下命令解压算例文件。

```
tar -zxvf  Amber20_Benchmark_Suite.tar.gz
```


4. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd PME/Cellulose_production_NPT_4fs/
```


5. 执行以下命令运行Amber测试。

```
cp ../Coordinates/Cellulose.inpcrd inpcrd
cp ../Topologies/Cellulose.prmtop prmtop
```

```
mpirun -np 96 $AMBERHOME/exe/pmemd -O -i mdin.CPU -o mdout.CPU -p prmtop -c inpcrd
```

```
$AMBERHOME/exe/pmemd.cuda -O -i mdin.GPU -o mdout.GPU -p prmtop -c inpcrd
```


  需要查看日志文件mdout.CPU中的“Performance”中的“ns/day”数值，单位是“ns/day”，数值越高性能越优。

  测试结果样例如下信息所示。

```
Final Performance Info:
|     -----------------------------------------------------
|     Average timings for last      10 steps:
|     Elapsed(s) =      40.80 Per Step(ms) =    4079.94
|         ns/day =       0.08   seconds/ns = 1019985.72
|
|     Average timings for all steps:
|     Elapsed(s) =     783.10 Per Step(ms) =    3915.48
|         ns/day =       0.09   seconds/ns =  978871.00
```