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title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入源码包目录。

```
cd
/path/to/
AlphaFold
```


3. 执行以下命令解压安装包。

```
tar -xvf
alphaFold
-xxx.tar.gz
```


  “xxx”表示软件版本号。

4. 执行以下命令进入解压后路径。

```
cd alphafold
```


5. 执行以下命令进行安装。

```
pip3 install --upgrade pip
&& pip3 install -r ./requirements.txt
&& pip3 install --upgrade "jax[cuda111]" -f
https://storage.googleapis.com/jax-releases/jax_releases.html
&& pip3 install jaxlib==0.1.70+cuda111 -f
https://storage.googleapis.com/jax-releases/jax_releases.html
# work_path=
/path/to/alphafold-code
work_path=$(PWD)
# update openmm
a=$(which python)
cd $(dirname $(dirname $a))/lib/python3.8/site-packages
patch -p0 < $work_path/docker/openmm.patch
```


6. 执行以下命令下载database脚本。

```
wget https://github.com/kalininalab/alphafold_non_docker/blob/main/download_db.sh
```


7. 执行以下命令开始下载alphafold_data数据文件。

```
bash download_db.sh -d </home/johndoe/alphafold_data>
```