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title: 安装Samtools
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 安装Samtools

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压Samtools安装包。

```
tar -xvf samtools-1.10.tar.bz2
```


3. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd samtools-1.10
```


4. 执行以下命令进行安装。

```
yum install -y bzip2-devel bzip2-libs bzip2
```


5. 执行以下命令进行配置。

```
./configure --prefix=
/path/to/SAMTOOLS
```


6. 执行以下命令进行编译安装。

```
make all all-htslib
make install install-htslib
```


7. 执行以下命令设置Samtools的环境变量。

```
export PATH=
/path/to/SAMTOOLS
/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=
/path/to/SAMTOOLS
/lib:$LD_LIBRARY_PATH
```