---
title: 安装Samtools
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengaugustus_02_0008.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengaugustus_02_0008.html
indexId: 7533734445c5d0215c73fc08f2970dedd3140a5505f070340018984df6b9d88e70
---
# 安装Samtools

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令，安装依赖。

```
yum install -y ncurses ncurses-base ncurses-libs ncurses-devel
```


3. 使用SFTP工具将Samtools安装包上传至服务器“/path/to/AUGUSTUS”目录。
4. 执行以下命令，解压安装包。

```
cd
/path/to
/AUGUSTUS
&& tar -zxf samtools-1.11.tar.gz
```


5. 执行以下命令，重命名并进入安装目录。

```
mv samtools-1.11 samtools && cd samtools
```


6. 执行以下命令，进行配置。

```
autoheader
autoconf
sed -i 's/\-O2/\-O3 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110/g' `grep -lr "\-O2" ./`
CC=`which gcc` ./configure --prefix=
/path/to
/AUGUSTUS
/samtools
```


7. 执行以下命令，进行编译安装。

```
make -j 16
make install
```