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title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 运行和验证

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令，将“data”目录下的算例拷贝到“TESTCASE”目录。

```
cd
/path/to/BEDTOOLS/bedtools2/data
cp
gerp.chr1.bed.gz
aluY.chr1.bed.gz
/path/to/TESTCASE
```


3. 执行以下命令，解压算例。

```
cd
/path/to/TESTCASE
gzip -d gerp.chr1.bed.gz
gzip -d aluY.chr1.bed.gz
```


4. 执行以下命令，输出两个文件的overlap。

```
bedtools intersect -a aluY.chr1.bed -b gerp.chr1.bed
```


  结果示例如下图所示，则表示运行成功。