---
title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengbioconductormanta_02_0008.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengbioconductormanta_02_0008.html
indexId: 2ada0a5d03337d654824b52a812e227d59f16efb05cd3f68b7080ebf81caa1db79
---
# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令安装相关依赖。

```
R
install.packages("BiocManager")
```


  回显显示信息如下图所示。

3. 执行以下命令安装bioconductor-manta的依赖。

```
BiocManager::install("edgeR")
BiocManager::install("Hmisc")
BiocManager::install("caroline")
q()
```


4. 执行以下命令安装bioconductor-manta。

```
cd
/path/to/bioconductor-manta
R CMD INSTALL manta_1.32.0.tar.gz
```


  回显显示信息如下图所示。