---
title: 介绍
description: "Bowtie是一种超快速，内存高效的短读比对仪，旨在将大批短的DNA序列（读段）与大基因组快速比对。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengbowtie_02_0001.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengbowtie_02_0001.html
indexId: d829bccea1f8519554949ae0f4e07aa332b9a27839d370018e006f4b949742f068
---
# 介绍

Bowtie是一种超快速，内存高效的短读比对仪，旨在将大批短的DNA序列（读段）与大基因组快速比对。

Bowtie使用Burrows-Wheeler索引对基因组进行索引，以保持其内存占用量小，对于人类基因组，该索引通常约为2.2GB（用于非配对比对）或2.9GB（用于配对末端或色彩空间比对），同时使用多个处理器以获得更高的对齐速度。

关于Bowtie的更多信息请访问Bowtie官网(http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml)。

语言：C语言。

一句话描述：一种超快速，高效存储的短阅读比对仪，用于下一代测序仪的短DNA序列。

开源协议：GPL 3.0。

#### 建议的版本

建议使用的版本“Bowtie 1.2.3”。
