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title: 获取源码
description: "1. 下载如下软件包和算例文件。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengbowtie_02_0005.html
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# 获取源码

#### 操作步骤

1. 下载如下软件包和算例文件。

  - 下载Bowtie安装包“bowtie-1.2.3.zip”。
    下载地址：https://github.com/BenLangmead/bowtie/archive/v1.2.3.zip(https://github.com/BenLangmead/bowtie/archive/v1.2.3.zip)

  - 下载simde-master安装包“simde-master.zip”。
    下载地址：https://codeload.github.com/nemequ/simde/zip/master(https://codeload.github.com/nemequ/simde/zip/master)

  - 下载sse2neon-master安装包“sse2neon-master.zip”。
    下载地址：https://codeload.github.com/jratcliff63367/sse2neon/zip/master(https://codeload.github.com/jratcliff63367/sse2neon/zip/master)

  - 下载人类基因组包“chromFa.tar.gz”。
    下载地址：https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bigZips/chromFa.tar.gz(https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bigZips/chromFa.tar.gz)

  - 下载SRR742200_1.fastq算例文件“SRR742200_1.fastq.gz”。
    下载地址：http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_1.fastq.gz(http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_1.fastq.gz)

  - 下载SRR742200_2.fastq算例文件“SRR742200_2.fastq.gz”。
    下载地址：http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_2.fastq.gz(http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_2.fastq.gz)

2. 使用SFTP工具将如下软件包和算例文件上传至服务器对应目录。

  - 将Bowtie安装包上传至服务器“/path/to/BOWTIE”目录。
  - 将simde-master安装包上传至服务器“/path/to/SIMDE”目录。
  - 将sse2neon-master安装包上传至服务器“/path/to/SSE2NENO”目录。
  - 将chromFa.tar.gz安装包上传至服务器“/path/to/CHROMFA”目录。
  - 将算例文件“SRR742200_1.fastq.gz”上传至服务器“/path/to/CHROMFA/man_hg19/”目录
  - 将算例文件“SRR742200_2.fastq.gz”上传至服务器“/path/to/CHROMFA/man_hg19/”目录