--- title: 故障排除 description: "现象描述：" url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengchaste_02_0018.html sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengchaste_02_0018.html indexId: 5d75281a283318adfcb6c936e06b2122608d62be231c3fc9a16151d39759ba0b68 --- # 故障排除 #### 问题一：petsc配置过程中报错 现象描述： 运行./configure后报错，报错信息如下： ``` . This script, last modified 2008-01-23, has failed to recognize the operating system you are using. It is advised that you download the most up to date version of the config scripts from http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.guess;hb=HEAD and http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.sub;hb=HEAD ``` 可能原因： “config.guess”和“config.sub”两个证书过期。 处理步骤： 1. 执行以下命令搜索“config.guess”和“config.sub”文件。 ``` find ./ -name config.guess find ./ -name config.sub ``` 2. 将文件中的内容更新为网址中的内容。 config.guess： http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.guess;hb=HEAD(http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.guess;hb=HEAD) config.sub： http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.sub;hb=HEAD(http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.sub;hb=HEAD) #### 问题二：Boost安装过程中报错 现象描述： 运行./b2 install后报错，报错信息：“gcc: error: unrecognized command line option ‘-m64’”。 可能原因： -m64是x86 64位应用编译选项，m64选项设置int为32bits及long、指针为64bits，为AMD的x86 64架构生成代码。在ARM64平台无法支持。 处理步骤： 执行以下命令修改Boost中的源码，将ARM64平台对应的编译选项设置为-mabi=lp64： ``` sed -ri 's/\-m64/\-mabi=lp64/g' `grep -Rl '\-m64'` ``` #### 问题三：Python配置过程中报错 现象描述： 运行./configure后报错，报错信息：“gcc: error: directory": No such file or directory”。 可能原因： Python老版本的bug。 处理步骤： 执行以下命令： ``` SVNVERSION=not-found ./configure ``` #### 问题四：Chaste安装过程中报错 现象描述： 运行make -j48 Continuous后报错，报错信息：“AttributeError: 'str' object has no attribute 'format'”。 可能原因： Format是python2.6新增的一个格式化字符串的方法。 处理步骤： 执行以下命令修改“translators.py”文件。 1. 打开“translators.py”文件。 ``` vim /path/to/CHASTE /Chaste-release_2019.1/python/pycml/translators.py ``` 2. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。 将1830行取消注释，将1831行注释掉。 将1838行取消注释，将1839行注释掉。 修改前： ``` 1830 #self.writeln('std::cout << "Too small: ', self.code_name(var), ' = " << ', self.code_name(var) , ' << std::endl << std::flush;') 1831 self.writeln(error_template.format(self.var_display_name(var))) 1832 self.close_block(False) 1833 for var in high_range_vars: 1834 if using_cvode: 1835 additional_tolerance_adjustment = ' + tol' 1836 self.writeln('if (', self.code_name(var), ' > ', var.get_rdf_annotation(high_prop), additional_tolerance_adjustment, ')') 1837 self.open_block() 1838 #self.writeln('std::cout << "Too large: ', self.code_name(var), ' = " << ', self.code_name(var) , ' << std::endl << std::flush;') 1839 self.writeln(error_template.format(self.var_display_name(var))) ``` 修改后： ``` 1830 self.writeln('std::cout << "Too small: ', self.code_name(var), ' = " << ', self.code_name(var) , ' << std::endl << std::flush;') 1831 #self.writeln(error_template.format(self.var_display_name(var))) 1832 self.close_block(False) 1833 for var in high_range_vars: 1834 if using_cvode: 1835 additional_tolerance_adjustment = ' + tol' 1836 self.writeln('if (', self.code_name(var), ' > ', var.get_rdf_annotation(high_prop), additional_tolerance_adjustment, ')') 1837 self.open_block() 1838 self.writeln('std::cout << "Too large: ', self.code_name(var), ' = " << ', self.code_name(var) , ' << std::endl << std::flush;') 1839 #self.writeln(error_template.format(self.var_display_name(var))) ``` 3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。