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title: 编译和安装
description: "1. 执行以下命令，清理环境。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengdelly_02_0007.html
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# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 执行以下命令，清理环境。

```
yum erase `yum list installed |grep boost|awk {'print $1'}` -y
```


2. 执行以下命令，安装依赖。

```
yum install -y libcurl libcurl-devel openssl openssl-devel zlib-devel bzip2 bzip2-devel xz-devel
```


3. 执行以下命令，设置环境变量。

```
export CPLUS_INCLUDE_PATH=$CPLUS_INCLUDE_PATH:/path/to/boost/include
export LIBRARY_PATH=$LIBRARY_PATH:/path/to/boost/lib
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/boost/lib
```


4. 执行以下命令，解压Delly和htslib安装包。

```
cd
/path/to
/DELLY
&& tar -zxf v0.8.5.tar.gz && tar -zxf 1.10.2.tar.gz
```


5. 执行以下命令，将htslib的源码移动到Delly源码下的“src/htslib”目录里。

```
mv htslib-1.10.2/* delly-0.8.5/src/htslib/
```


6. 执行以下命令，修改“Makefile”文件。

```
cd
/path/to
/DELLY
/delly-0.8.5
sed -i 's/g++/`which g++`/g'
Makefile
sed -i 's/\.\/configure/CC=`which gcc` CXX=`which g++` \.\/configure/g' Makefile
sed -i 's/O3/
O3 -std=c++11 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110/g'
Makefile
```


7. 执行以下命令，进行编译。

```
CC=`which gcc` CXX=`which g++` make PARALLEL=1 all
```


  参数“PARALLEL=1”为开启多线程模式，不要此参数则不开启多线程模式。

8. 执行以下命令，加载环境变量。

```
export PATH=
/path/to
/DELLY/
delly-0.8.5/src:$PATH
```