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title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengfasta_02_0006.html
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# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压安装包。

```
tar -xvf fasta36-36.3.8h_04-May-2020.tar.gz
unzip sse2neon-master.zip
```


3. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cp sse2neon-master/sse2neon.h
/
path/to/FASTA
/
fasta36-36.3.8h_04-May-2020/src/
cd
/path/to/FASTA
/fasta36-36.3.8h_04-May-2020/make
```


4. 执行以下命令修改“Makefile.linux64_sse2”文件。

  a. 打开“Makefile.linux64_sse2”文件。

```
vim Makefile.linux64_sse2
```


  b. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

```
13 SHELL=/bin/bash
14
15 CC = gcc -g -O2 -march=armv8.2-a
16 LIB_DB=
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
5. 执行以下命令切换到src目录。

```
cd ../src
```


6. 执行以下命令修改“smith_waterman_sse2.c”文件。

  a. 打开“smith_waterman_sse2.c”文件。

```
vim smith_waterman_sse2.c
```


  b. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

```
23 #include "sse2neon.h"
24 #endif
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
7. 执行以下命令修改“global_sse2.c”文件。

  a. 打开“global_sse2.c”文件。

```
vim global_sse2.c
```


  b. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

```
21 #else
22 #include "sse2neon.h"
23 #endif
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
8. 执行以下命令修改“glocal_sse2.c”文件。

  a. 打开“glocal_sse2.c”文件。

```
vim glocal_sse2.c
```


  b. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

```
21 #else
22 #include "sse2neon.h"
23 #endif
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
9. 执行以下命令进行编译和安装。

```
make -f ../make/Makefile.linux64_sse2
```


10. 执行以下命令进入“data”目录。

```
cd
/path/to/FASTA
/fasta36-36.3.8h_04-May-2020/data
```