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title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengfastqc_02_0009.html
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# 运行和验证

#### 操作步骤（命令行使用方法）

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建测试目录。

```
mkdir -p
/path/to/FASTQC
/test
```


3. 执行以下命令复制测试算例到测试目录，并进入测试目录。

```
cp SRR742200_1.fastq.gz
/path/to/FASTQC
/test
cd
/path/to/FASTQC
/test
```


4. 执行以下命令解压测试算例。

```
gzip -d SRR742200_1.fastq.gz
```


5. 执行以下命令运行测试。

```
/path/to/FASTQC
/FastQC/fastqc -o ./ ./SRR742200_1.fastq
```


6. 运行完成后会生成“SRR742200_1_fastqc.html”和“SRR742200_1_fastqc.zip”，执行以下命令可查看文件是否存在。

```
ll
```


  使用浏览器打开“html”文件查看结果。


#### 操作步骤（图形界面使用方法）

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令登录图形化界面。

```
/path/to/FASTQC
/FastQC/fastqc
```


3. 单击左上角“File > Open”，选择算例。
4. 选择算例后单击“Open”，显示如下图则表示在运行测试。
  结果样例如图1所示。

  图1 结果样例