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title: 安装Samtools
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 安装Samtools

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压Samtools安装包。

```
tar -xvf samtools-0.1.9.tar.bz2
```


3. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd samtools-0.1.9
```


4. 执行以下命令安装依赖包。

```
yum install xz-devel-5.2.2-1.el7.aarch64 bzip2-devel-1.0.6-13.el7.aarch64 ncurses-devel.aarch64 -y
```


5. 执行以下命令进行配置。

```
./configure --prefix=
/path/to/SAMTOOLS
```


6. 执行以下命令进行编译。

```
make
make install
```


7. 执行以下命令设置Samtools的环境变量。

```
export PATH=
/path/to/SAMTOOLS
/bin:$PATH
```


8. 执行以下命令验证Samtools安装是否成功。

```
samtools
```


  显示类似如下Samtools使用信息，说明安装成功。

```
Program: samtools (Tools for alignments in the SAM format)
Version: 0.1.9 (r183)
Usage:   samtools <command> [options]
```