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title: 介绍
description: "HH-suite是一个开源软件包，用于基于隐马尔可夫模型（HMM）的成对比对进行敏感蛋白质序列搜索。它包含HHsearch和HHblits以及其他程序和实用程序。HHsearch将多序列比对（MSA）或配置文件HMM作为输入，并在HMM数据库（例如PDB、Pfam或InterPro）中搜索同源蛋白质。HHsearch通常用于蛋白质结构预测，以检测同源模板并为同源建模构建高度准确的查询模板配对比对。"
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# 介绍

HH-suite是一个开源软件包，用于基于隐马尔可夫模型（HMM）的成对比对进行敏感蛋白质序列搜索。它包含HHsearch和HHblits以及其他程序和实用程序。HHsearch将多序列比对（MSA）或配置文件HMM作为输入，并在HMM数据库（例如PDB、Pfam或InterPro）中搜索同源蛋白质。HHsearch通常用于蛋白质结构预测，以检测同源模板并为同源建模构建高度准确的查询模板配对比对。

关于HH-suite的更多信息请访问HH-suite相关网站(https://github.com/soedinglab/hh-suite/wiki)。

语言：C/C++/Perl。

一句话描述：远程蛋白质同源性检测套件。

开源协议：GPL-3.0。

#### 建议的版本

建议使用的版本为“HH-suite v3.3.0”。