---
title: 介绍
description: "HOMER是一种新的基序发现算法，专为基因组学应用中的调控元件分析而设计（仅DNA，无蛋白质），它是用Perl和C++编写的UNIX风格的命令行操作系统。HOMER包含许多有用的工具，可用于分析ChIP-Seq、GRO-Seq、RNA-Seq、DNase-Seq、Hi-C和许多其他类型的功能基因组测序数据。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpenghomer_02_0001.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpenghomer_02_0001.html
indexId: d890dd756f4cb02f7ffddeca37e433fbeeef91a2e5e9e8c28b1e8793cd678f0967
---
# 介绍

HOMER是一种新的基序发现算法，专为基因组学应用中的调控元件分析而设计（仅DNA，无蛋白质），它是用Perl和C++编写的UNIX风格的命令行操作系统。HOMER包含许多有用的工具，可用于分析ChIP-Seq、GRO-Seq、RNA-Seq、DNase-Seq、Hi-C和许多其他类型的功能基因组测序数据。

关于HOMER的更多信息请访问HOMER官网(http://homer.ucsd.edu/homer/)。

语言：Perl、C++。

一句话描述：HOMER是用Perl和C++编写的UNIX风格的命令行操作系统。

开源协议：自定义开源协议。

#### 建议的版本

建议使用的版本为“HOMER 4.11”。