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title: 安装Bowtie2
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 安装Bowtie2

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令删除HUMAnN自行安装的Bowtie2。

```
rm -rf
/
path
/to
/
python-3.9.6
/bin/bowtie2*
```


3. 下载Bowtie2安装包。
  下载地址：http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.4.2/bowtie2-2.4.2-linux-aarch64.zip(http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.4.2/bowtie2-2.4.2-linux-aarch64.zip)

4. 执行以下命令解压安装包。

```
unzip bowtie2-2.4.2-linux-aarch64.zip
```


5. 执行以下命令修改配置文件。

  a. 打开配置文件。

```
vi /etc/profile
```


  b. 按“i”进入编辑模式，添加Bowtie2路径。

```
export PATH=/home/gcc-9.3.1-2020.12-aarch64-linux/bin:/usr/local/python-3.9.6/bin:/home/bowtie2-2.4.2-linux-aarch64:$PATH
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令使配置文件生效。

```
source /etc/profile
```


7. 执行以下命令验证Bowtie2是否安装成功。

```
bowtie2 -h
```


  显示如下内容，表示安装成功。