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title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengkmersgwas_02_0013.html
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# 运行和验证

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令设置环境变量。

```
export PATH=
/path/to/KMERSGWAS
/kmersGWAS-0.2-beta/bin:$PATH
export PATH=
/path/to/R
/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=
/path/to/OPENBLAS
/lib:$LD_LIBRARY_PATH
```


3. 执行以下命令进入算例目录解压算例并将算例移动到指定目录。

```
cd
/path/to/CASE
tar -zxf A_thaliana_1001G_kmers_table.tar.gz
mv
A_thaliana_1001G_kmers_table
/path/to/KMERSGWAS
/kmersGWAS-0.2-beta/examples/flowering_time_arabidopsis/
```


4. 执行以下命令进入算例执行目录。

```
cd
/path/to/KMERSGWAS
/kmersGWAS-0.2-beta/examples/flowering_time_arabidopsis/
```


5. 执行以下命令运行算例。

```
{ time python2.7 ../../kmers_gwas.py --pheno FT10.pheno --kmers_table A_thaliana_1001G_kmers_table/kmers_table -l 31 -p 128 --outdir run_GWAS_FT10_kp_`date '+%Y%m%d%H%M%S'`; } 2>&1 | tee -a `hostname`_`date '+%Y%m%d%H%M%S'`.log
```


  运行结果信息示例如图1所示。

  图1 运行结果示例