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title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压KneadData安装包。

```
cd
/path/to/
kneaddata
unzip kneaddata-0.7.7-alpha.zip
```


3. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd kneaddata-0.7.7-alpha
```


4. 执行以下命令编辑“setup.py”文件。

  a. 打开“setup.py”文件。

```
vi setup.py
```


  b. 按照下图添加“import shutil”，后面拷贝Bowtie2文件使用。
  c. 在“def download_unpack_zip”模块内，添加如下内容。

```
test1 = r'
/
path/to
/Bowtie2
/bowtie2-2.4.2-linux-aarch64.zip'
shutil.copy(test1,download_file)
```


  d. 搜索“if not bowtie2_installed or replace_install”。
    注释掉包含“bowtie2-2.2.3-linux.x86_64.zip”的两行，添加如下内容：

```
bowtie2_file="bowtie2-2.4.2-linux-aarch64.zip"
bowtie2_url="http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.4.2/bowtie2-2.4.2-linux-aarch64.zip"
```


    注释掉bowtie2_folder=”bowtie2-2.2.3”，添加如下内容：

```
bowtie2_folder="bowtie2-2.4.2-linux-aarch64"
```


5. 执行以下命令进行安装。

```
python setup.py install
```