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title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 运行和验证

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令验证安装是否完成。

```
cd /path/to/LTR_retriever/LTR_retriever-2.9.0
./LTR_retriever -h
```


  回显显示信息如下图所示。

3. 执行以下命令并运行。

```
mkdir test && cd test
wget http://ftp.ensembl.org/pub/release-106/fasta/gallus_gallus/dna/Gallus_gallus.GRCg6a.dna.chromosome.16.fa.gz
gunzip Gallus_gallus.GRCg6a.dna.chromosome.16.fa.gz
mv Gallus_gallus.GRCg6a.dna.chromosome.16.fa Gallus.fa
gt suffixerator -db genome.fa -indexname genome.fa -tis -suf -lcp -des -ssp -sds -dna
gt ltrharvest -index genome.fa -minlenltr 100 -maxlenltr 7000 -mintsd 4 -maxtsd 6 -motif TGCA -motifmis 1 -similar 85 -vic 10 -seed 20 -seqids yes > genome.fa.harvest.scn
LTR_retriever -genome genome.fa -inharvest genome.fa.harvest.scn
```


  回显显示信息如下图所示。