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title: 基本安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 基本安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建主程序安装目录。

```
mkdir -p
/path/to/MAFFT
```


3. 复制安装包至主程序安装目录。

```
cp
mafft-7.471-without-extensions-src.tgz
/path/to/MAFFT
```


4. 执行以下命令进入主程序安装目录。

```
cd
/path/to/MAFFT
```


5. 执行以下命令解压安装包。

```
tar -xvf
mafft-7.471-without-extensions-src.tgz
```


6. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd mafft-7.471-without-extensions/core
```


7. 执行以下命令配置相关文件。

```
perl -p -i -e 's#PREFIX =.*#PREFIX =
/PATH/to/MAFFT
#' Makefile
sed -i 's/gcc/\`which gcc\`/g' Makefile
sed -i 's/-O3/-O3 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110 -flto/g' Makefile
```


8. 编译安装MAFFT主程序。

  a. 执行以下命令编译安装主程序。

```
make clean
make
make install
```


  b. 执行以下命令添加环境变量。

```
export
PATH=
/path/to/MAFFT
/bin:$PATH
```